Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms