Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh8D3Z6W3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh8D3Z6W3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh8D3Z6W3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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