Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms