Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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