Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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