Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms