Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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