Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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