Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms