Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Col4a3Q9QZS0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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