Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.8 ms