Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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