Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Kcnip3Q9QXT8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms