Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tcea2Q9QVN7 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcea2Q9QVN7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms