Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1eQ9JMK2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1eQ9JMK2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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