Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
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Col5a3Q9JLI2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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