Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmod4Q9JLH8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod4Q9JLH8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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