Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Nectin3Q9JLB9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nectin3Q9JLB9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms