Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms