Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms