Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms