Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms