Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem27Q9ESG4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem27Q9ESG4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms