Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc4Q9ES56 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms