Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn2Q9ER65 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms