Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms