Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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Vmn1r54Q9EPB8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r54Q9EPB8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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