Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Swt1Q9DBQ9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Swt1Q9DBQ9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms