Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms