Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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PrameQ9D4Z5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PrameQ9D4Z5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PrameQ9D4Z5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrameQ9D4Z5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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