Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lonrf3Q9D4H7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lonrf3Q9D4H7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lonrf3Q9D4H7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lonrf3Q9D4H7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lonrf3Q9D4H7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lonrf3Q9D4H7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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