Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem53Q9D0Z3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms