Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem88Q9D0N8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms