Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms