Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sgo1Q9CXH7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sgo1Q9CXH7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sgo1Q9CXH7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sgo1Q9CXH7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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