Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Utp23Q9CX11 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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