Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnot11Q9CWN7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnot11Q9CWN7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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