Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atxn3Q9CVD2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atxn3Q9CVD2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms