Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PclafQ9CQX4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PclafQ9CQX4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms