Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ykt6Q9CQW1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ykt6Q9CQW1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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