Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms