Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup155Q99P88 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms