Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms