Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tdrd1Q99MV1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms