Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrrtQ99MR6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms