Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms