Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab28Q99KL7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms