Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms