Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lims1Q99JW4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lims1Q99JW4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lims1Q99JW4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lims1Q99JW4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lims1Q99JW4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lims1Q99JW4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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