Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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